MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus REY15A chromosome

Total Repeats: 8467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017276	GT	3	6	24	29	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017276	ATT	2	6	135	140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017276	GTCAC	2	10	202	211	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017276	ATT	2	6	228	233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017276	TAA	2	6	279	284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017276	T	8	8	290	297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017276	TAAA	2	8	2213	2220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017276	TA	5	10	2229	2238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017276	T	6	6	3095	3100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017276	T	6	6	3119	3124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017276	TAT	2	6	4718	4723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017276	TACAAA	2	12	5587	5598	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017276	TAT	2	6	5684	5689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017276	AAG	2	6	5722	5727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017276	TTAAA	2	10	5728	5737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017276	ACA	2	6	5741	5746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017276	GAA	2	6	5939	5944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017276	ATGTT	2	10	5957	5966	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017276	TGTGA	2	10	5991	6000	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017276	GA	3	6	6009	6014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017276	ATC	2	6	6033	6038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017276	GTTC	2	8	6047	6054	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017276	TCA	2	6	6056	6061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017276	T	6	6	7539	7544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017276	TA	3	6	7559	7564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017276	TA	3	6	8901	8906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017276	GTA	2	6	8914	8919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017276	CATC	2	8	9748	9755	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017276	ATT	2	6	16184	16189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017276	TGGTAT	2	12	17652	17663	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017276	TAA	2	6	17689	17694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017276	TTA	2	6	17699	17704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017276	TAT	2	6	17751	17756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017276	CAT	2	6	17777	17782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017276	GGTT	2	8	17797	17804	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017276	ATT	2	6	17823	17828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017276	TAT	2	6	17838	17843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017276	ACTG	2	8	17856	17863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017276	AAC	2	6	18570	18575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017276	T	6	6	20544	20549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017276	ATC	2	6	23298	23303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017276	GAT	2	6	24408	24413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017276	TGA	2	6	24437	24442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017276	GAT	2	6	24461	24466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017276	TAGA	2	8	24481	24488	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017276	ATA	2	6	24509	24514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017276	CA	3	6	26172	26177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017276	AT	3	6	26178	26183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017276	TAA	2	6	26915	26920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017276	AAAAT	2	10	26997	27006	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017276	ATAA	2	8	28067	28074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017276	TA	3	6	28082	28087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017276	TAT	2	6	28110	28115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017276	TTA	2	6	31278	31283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017276	AGA	2	6	31310	31315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017276	AT	3	6	32545	32550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017276	CTTTTC	2	12	32570	32581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017276	ATC	2	6	32624	32629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017276	ACA	2	6	32634	32639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017276	TAA	2	6	34060	34065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017276	TAC	2	6	34096	34101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017276	GGT	2	6	34111	34116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017276	T	6	6	35128	35133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017276	ATT	2	6	35924	35929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017276	TGC	2	6	35947	35952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017276	ATTTT	2	10	36011	36020	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017276	TAAA	2	8	36095	36102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017276	TAT	2	6	36175	36180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017276	ACT	2	6	36823	36828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017276	TATTTA	2	12	38098	38109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017276	A	6	6	38136	38141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017276	AT	4	8	38339	38346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017276	ATTT	2	8	38353	38360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017276	AAAT	2	8	38364	38371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017276	AT	3	6	38373	38378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017276	AAAT	2	8	38429	38436	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017276	AT	3	6	38435	38440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017276	GAT	2	6	38461	38466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017276	CTG	2	6	38502	38507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017276	ATT	2	6	38533	38538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017276	TTC	2	6	38559	38564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017276	TAA	2	6	38625	38630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017276	TAA	2	6	38719	38724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017276	ATT	2	6	38832	38837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017276	AATA	2	8	38839	38846	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017276	TGGTG	2	10	38879	38888	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017276	AT	3	6	40636	40641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017276	TA	4	8	42310	42317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017276	GTT	2	6	44580	44585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017276	TTA	2	6	44599	44604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017276	ATC	2	6	44619	44624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017276	TAGC	2	8	45621	45628	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017276	TAA	2	6	45718	45723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017276	GTT	2	6	45731	45736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017276	TGA	2	6	45788	45793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017276	T	7	7	45801	45807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017276	TCT	2	6	45821	45826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017276	TC	3	6	47956	47961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017276	TCTAGT	2	12	47968	47979	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017276	TCAA	2	8	48040	48047	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017276	TTA	2	6	48065	48070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017276	AGA	2	6	48077	48082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017276	TAT	2	6	48101	48106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017276	TAT	2	6	49529	49534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017276	ATA	2	6	49535	49540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017276	T	6	6	50742	50747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017276	TTG	2	6	50759	50764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017276	AAGT	2	8	50834	50841	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017276	CAA	2	6	50874	50879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017276	TTAT	2	8	50910	50917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017276	ATCT	2	8	50925	50932	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017276	AGA	2	6	58059	58064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017276	AACA	2	8	58657	58664	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017276	CA	3	6	58737	58742	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017276	TAA	2	6	58743	58748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017276	GAA	2	6	58779	58784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017276	TCC	2	6	58810	58815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017276	TGA	2	6	58831	58836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017276	ATG	2	6	58856	58861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017276	T	7	7	58895	58901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017276	TAATT	2	10	60863	60872	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017276	CTT	2	6	60915	60920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017276	GTTT	2	8	65216	65223	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017276	TAT	2	6	65234	65239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017276	A	6	6	65289	65294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017276	ATT	2	6	65318	65323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017276	TTG	2	6	67942	67947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017276	TAA	2	6	67988	67993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017276	TTA	2	6	68001	68006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017276	TCAT	2	8	68008	68015	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017276	ACT	2	6	68703	68708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017276	TCTA	2	8	68736	68743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017276	A	6	6	68743	68748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017276	TTC	2	6	68775	68780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017276	TAA	2	6	68819	68824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017276	TAA	2	6	68867	68872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017276	TAT	2	6	68873	68878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017276	AT	4	8	68894	68901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017276	TTC	2	6	69463	69468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017276	CAT	3	9	69489	69497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017276	TA	3	6	70020	70025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017276	TA	3	6	70063	70068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017276	CT	3	6	71382	71387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017276	TAT	2	6	71438	71443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017276	AAC	2	6	71874	71879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017276	AATAAA	2	12	71884	71895	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017276	GTTTT	2	10	71900	71909	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017276	GAT	2	6	72794	72799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_017276	GAG	2	6	249069	249074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_017276	CTA	2	6	249218	249223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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475	NC_017276	G	6	6	249300	249305	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
476	NC_017276	ATT	3	9	249318	249326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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